传统的化粪池存在去除有机物能力差、不符合卫生标准，定期抽粪、运输量大，管理不便、易发生沼气爆炸事件相比，沼气池具有以下有优越性：
一是有机物去除率高，COD去除率达78%以上，BOD去除率达82%以上：
二是阻止污泥上浮，并通过多级过滤，出水呈中性，卫生环保效果好，基本能达标：
三是可获一定的优质燃气--沼气。但是沼气池同样存在问题，出水色度普遍偏高，同时NH3-N去除率也不易达标。